単位が違う変数同士の変数重要度を比較してもいいのでしょうか?

問題ございません。これは、変数重要度は、変数の単位とは関係ないところで計算されているからです。

なお、変数重要度につきましては、以下のリンクで詳しく紹介していますので、ご参考ください。

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