大量の列があり、特徴量を削減していきたい時にはSVDといったアルゴリズムがおすすめです。
下記のノートの「SVDのアルゴリズムを使って次元削減する」といったセクションにて、ExploratoryでのSVDの使い方がありますのでご参照ください。
